PTBタンパク質ドメイン

PTB (Phosphotyrosine binding) ドメインは、100–150アミノ酸残基のモジュールで、共通してAsn-Pro-X-Tyrモチーフに結合します。ドッキングタンパク質ShcおよびIRS-1のPTBドメインは、チロシン残基がリン酸化されたリガンド (NPXpY) を認識して結合します。また、高い親和性と特異性獲得のためには、これに加えてN末端配列が必要になります。このペプチドは逆平行のβシートに対してβストランドとして結合しますが、一方、NPXpYモチーフは塩基性アミノ酸残基によって認識されるためにpY位置で折り返します。X11、Dab、Fe65、Numbなどのタンパク質のPTBドメインは、NPXYや関連ペプチドモチーフを明確に認識しますが、リガンドのリン酸化には依存しません。さらに、NumbのPTBドメインは、ヘリックス状のターンを形成する無関係のペプチドに結合することができます。