GATタンパク質ドメイン
ヒトGGA1のGATドメイン
ドメイン結合および機能
GAT (GGA and Tom1) ドメインは、GTP結合型ARFに結合し、GGAをトランスゴルジネットワークの膜へリクルートする機能を持ちます。N末端のサブドメインは、GTP結合型ARFとGATの結合に重要で、C末端のサブドメインはユビキチンと結合することができます。GATドメインのユビキチンへの結合は、GTP結合型ARFの存在下で促進されます。GATドメインは、SNAREファミリーと構造的な相同性があり、同型の3つのヘリックス束をもっています。このためGATドメインは膜融合に関与すると推測されています。GGA1とGGA3はARF-GTPおよびユビキチンと相互作用しますが、GGA2およびTom1中のGATの機能は現在のところ不明です。
構造
N-GATサブドメイン、またはフックサブドメインは、ヘリックス-ループ-ヘリックス構造で構成され、2番目の長いヘリックスα1のN末端側半分がARF結合に関与します。C‐GATサブドメインは、C末端半分のα1、α2、α3の3つのヘリックス束を構成します。ユビキチンの結合は、GATドメインのα3ヘリックスの片側のアミノ酸残基と、ユビキチンの表面にある44番目のイソロイシン (Ile-44) との間の相互作用によって媒介されます。
構造の参考文献
- Suer, S. et al. (2003) PNAS 100(8), 4451–4456.
- Shiba, T. et al. (2003) Nat. Struc. Biol. 10(5), 386–392.
- Shiba, Y. et al. (2004) JBC 279(8), 7105–7111.
ドメインタンパク質の例
結合の例
GATドメインタンパク質 | 結合パートナー |
GGA1 | ARF1 |
GGA2 | ARF3 |
GGA3 | Rabaptin-5 |
Tom1 |
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